讲述了拥有高超医术的美女秘医零在很小的时候眼睛被器官贩卖组织（一直在大量收養年幼兒童，等兒童成長到一定年齡，再將其器官賣給需要動移植手術的買主的某個非法集团）卖掉了一只眼睛，失去一只眼睛的她，被一个自称为B.J.（BLACK JACK）的医生救回来了，并且B·J还给她移植了可以看到所有物质内部的眼睛。10年时间内，零掌握了大量的外科手术技巧，为了夺回自己的眼睛，她开始走上寻找自己被夺走的眼睛之路，向组织一步步逼近。《怪医美女RAY》是吉富昭仁所作漫画作品，这部动画就是依据漫画改编的。此作品中的出现的角色B.J.，就是手冢治虫作品里的怪医黑杰克。